式对所有中层以上的军官进行集中培训，实行竞争上岗制，不合格者淘汰到团练营去任职，一番整合后，精兵强将之策初见成效——六营满编六千六百人，步、骑各半，但无论步、骑均以马代步，只是战时步兵下马列阵而战罢了，每营设校尉一人，分别为：骑甲营校尉刘旋风、骑乙营校尉沙飞驼、骑丙营校尉原楼兰镇守使林挺、步甲营校尉鹰三、步乙营校尉原西州镇守使贺大才、步丙营校尉游思凡；骑兵统制官为陈武，步兵统制官为林承鹤，王府亲卫队长之责由燕十八接任，副典军则是鹰大；原先四镇合并为大西州，由都护府掌总，具体民政由莫离负责，而由秦文华出任大西州刺史一职，其下设四县，各县令由都护府委任，并报朝廷审核，至贞观十七年元月底之前，诸般事宜算是具备的雏形，虽说离完备尚有差距，可毕竟算是开了个好头，幸亏李贞忙于内政之际正好是冬季歇兵之时，并无外敌骚扰，一切都顺当得很，倒也算是幸事一件。
正所谓幸与不幸是对双胞胎，就在李贞忙着整顿内务，无暇顾及外部事宜的当口，一件大事突如其来地降临了——西突厥乙毗咄陆可汗扣押了大唐派去宣抚的时节，并于贞观十七年元月二十一日兵五万余，号称八万，兵围伊州，叫嚣要剿灭安西唐军，此等意外的消息一传来，整个安西都护府立时震动了起来，人心惶惶不安，刚走上正规的内政立时面临着严峻的考验。
西突厥乃是大唐之强敌，占据了天山南北最富庶的草原，共有十大部落，另有附属之小部落无数，人口近六百万，善战之兵计四十余万，其现任可汗为乙毗咄陆，其人好战且贪婪，屡次对外用兵，曾灭了吐火罗、米国等中亚强国，对大唐也是屡屡犯边，劫掠无算，此次又找了个借口，言称大唐使节对其不敬，扣留了唐使，并不顾尚未到化冰时节的天时，悍然出兵围困伊州，其嚣张之气焰不言自明。
伊州地处瓜州（今甘肃安西东南）、沙州（今甘肃敦煌县城西）与西州之间，是戈壁滩上一片较大的绿洲，农业开较早。东汉明帝时击败匈奴，取其伊吾