进入忍者学校三年级之后，牙神御藏感觉到学业的压力更大了。
从三年级开始，他就要正式学习有关查克拉的理论，以及基础体术、投掷暗器等的训练。
得益于系统两年来发布的基础训练任务，牙神御藏的身体素质、身体协调能力以及反应速度都十分优秀，但牙神御藏是个藏拙的人，他已经低调惯了，所以整体的成绩，在班级只能算是中游偏上。
消失了小半年的佐助也回到了学校，他变得沉默而冷酷，似乎少年应该有的活泼朝气都随着那一个血腥的屠杀夜晚，从此消失不见了。
佐助的学习成绩非常好，手里剑、苦无、千本这些暗器，都用的十分熟练，变身术、分身术、替身术三身术掌握得也十分扎实，甚至已经掌握了宇智波家族强大的火遁天赋。
经过查克拉纸的测试，牙神御藏也是火属性，但他对此不以为意，有系统在身，他并不在意其他，只是一心想要练好刀法。
忍者世界的忍术秘法血继等等，可以说是一个无比庞大的力量体系。在牙神御藏看来，任何一项体系练到极致，都会成为这个世界实力顶端的人物。
在获得了第一个系统给予的技能之后，系统再次发布的训练任务，已经从基础的动作练习，变成了成套的刀法练习。
对于牙神御藏来说，他每天的时间都太宝贵了，除了要完成在学校的学习之外，还要完成系统的任务，所以他几乎没有时间玩耍。
在同班的许多同学看来，牙神御藏不过是个没有佐助帅气，没有佐助有天赋，不像佐助是个天才，却偏偏表现得跟佐助一样高傲不合群的少年，牙神御藏对此嗤之以鼻。
倒是武田桂足和多条川慎，三个人成为了最好的朋友。桂足是个活泼的性子，没心没肺的，在孤儿院就和所有的小孩关系都很好，现在和牙神御藏一个班级，两个人的住所离得也不算远，所以经常在一起。
而多条川慎，经过这两年的接触，牙神御藏发现他其实也是个很有趣的人，大概都是从孤儿