乌碣岩大战削弱了乌拉部的力量。努尔哈赤欣喜万分，以褚英"奋勇当先"，赐以"阿尔哈图图门"尊号。阿尔哈图图门是满语音译，即足智多谋之意。之后，在宜罕山城等战役中，褚英也是军功卓着，为努尔哈赤完成女真统一大业做出了重要贡献，堪称建立后金的卓越功臣。 因是长子，又屡建战功，被授命执掌国政。这年他才29岁。
褚英生性残暴、心胸狭隘，加之战功赫赫，不把任何人看在眼里，从而努尔哈赤的"开国五大臣"额亦都、费英东、何和礼、安费扬古和扈尔汉以及一些兄弟们与褚英不和。
"四大贝勒"即努尔哈赤四个子侄:建州没有立嫡以长的传统，诸弟们不满于褚英当嗣子、主国政的地位。但他们如果直接上告对长兄的不满，似有争嗣之嫌，于是决计同"五大臣"联合，倾轧褚英。 "五大臣"早年便追随努尔哈赤，威望高，权势重，历战阵，建殊勋，攻克图伦城时褚英尚在襁褓之中。五大臣也不满于褚英专军机、裁政事的地位，力求同"四贝勒"结合，共同扳倒褚英。"五大臣"首告嗣储褚英，似有贰心之嫌。
从褚英方面来说，他对"五大臣"这样建州的"柱石"和"元勋"，缺乏谦恭的态度;对诸弟又没有笼络的智术，而是想趁父汗努尔哈赤在世时，逐渐削夺他们的财富和权力，以便巩固自己的储位。这样的做法使"四贝勒"与"五大臣"人人自危，更促进了他们的联合。由是，褚英陷于孤立。双方矛盾的逐渐明朗化和日渐激化，使努尔哈赤不得不在长子褚英和"四贝勒"、"五大臣"之间作一个抉择。他反复权衡，最终决定疏远褚英。尔后两次进攻乌拉，努尔哈赤都没有派褚英出征，而让他在家留守。褚英非但没有从中汲取教训，反躬自省，暗自韬晦。相反"褚英意不自得，焚表告天自诉"，于是获"咀呪"之罪。万历四十一年(1613年)三月二十六日，努尔哈赤效法当年惩治的舒尔哈齐的办法，又命将长子褚英幽禁在高墙之中。
万历四十一年(1613年)他们控告褚英的"罪