电池改造是这个潜艇现代化改造中最大一块成本开销，在每一艘1.5亿元的改造预算下，剩下来的钱除了加装“鱼群”通讯系统和增加6枚鱼雷存放空间，潜龙现代化改造研究团队还重点将潜艇的电子系统进行全面更新改造，原来预算是只更新适合战区联合作战战术系统的主机，但是现在用于这个系统的主机系统由sal提供超级小型机，采用新g3芯片制造的小型机只需要几百万元就行，所以剩下的预算费用还能够将声呐子系统的计算主机也进行更新。
，也更新了运算核心，也就是说除了蓄电池动力系统和“鱼群”对外通讯系统改造外，整艘潜艇的电子系统完成了更新。
现在军方基于战区联合作战战术系统非常成熟，配合中华神盾开发的海空一体化作战系统在sal开发的g3系列新超级小型机上运行速度很快，单纯看运算能力，新的g3小型机运算能力比起潜艇老系统来说提升了不止一个数量级。
更为重要的是从中华神盾系统研发中使用的全新声呐智能分析引擎，让声呐系统的运作完全脱离人工判断阶段，新声呐智能分析引擎不但分析准确度比人工判断更高，而且反应时间更是不在一个数量级上，有了这个东西后，就可以实现潜艇观测瞄准和攻击一体化，这就让039改造型实验艇的自动化作战能力得到了极大的提升。
虽然从前期理论分析上看，进行现代化改造后的潜艇战力有了极大提升，大家对此寄以厚望，但是究竟结果怎么样，没有进行实战演练谁都没底。
这次新老潜艇的对抗演习的作战区域是在一个大约6万平方公里海域展开，时间是24小时，改造后的新潜艇充当进攻的蓝军，作战目标是在这个演习海域内生存24小时或者将红军潜艇全部击沉，而充当红军任务的4艘039潜艇则需要在24小时内找到并消灭蓝军，同时两架反潜直升机将在演习海域上空执行反潜侦察任务，同时实时无差别的将侦察结果向红、蓝双方潜艇演习区域发送，充当反潜预警机的角色。