在系统提供的完美火影世界背景说明中，火影忍者故事的发生地是一颗体积比某蓝星还要大一圈的星球。与某蓝星不同的是，这颗星球上不仅拥有着颇为浓郁的被这个世界的土著称之为自然能量的灵气，滋养万物孕育出了众多强大的生灵，还有着广阔且集中的陆地面积。
这个世界上，有近百分之七十的大陆板块是一个连续的整体，虽然中间也有大山大河与大漠的阻隔，但总体而言，却没有可以称得上是天堑的屏障；剩下的百分之三十左右的大陆板块虽然漂浮海外，但其中一个与主大陆相距不远的超级大岛就占据了其中的大半，剩下的才是一些零零散散的小岛。
在无尽历史长河中的某一天，某个叫做大筒木辉夜的贫瘠女人带来了神树种子以及修炼门槛更低成型速度更快的查克拉修炼体系，并主导了修炼查克拉的速成强者与使用自然能量的土著强者之间的第一次战争，查克拉体系逐渐开始取代传统的自然力量修炼体系。
不久之后，大筒木辉夜被两个逆子囚禁在暗无天日的小黑屋里，而之后她的两个逆子开始了不知羞耻的造人过程，诞生了众多的后代，并主导了第二次查克拉体系与土著强者的战争。
在漫长的岁月，已经人类化的大筒木一族的后裔和这个世界本土的众多天才血脉不断融合发展，逐渐演化成了一个个实力强横的忍者家族，并诞生了众多强大的血继限界。这些事例强大的忍者家族利用同属人族的优势，与武士家族、阴阳师家族等本土人类家族达成协议，一致对外，将矛头首先对准了修炼自然能量的异兽族群。
面对人类的空前团结以及大筒木一族时不时弄出尾兽来拉偏架，众多非我族类的异兽群落先后被人类击败灭族，它们所占据的山河沃土通通称为了人族的战利品。只剩下部分拥有次位面或者穷山恶水的族群才侥幸活了下来，并屈辱的签订了通灵契约，以通灵兽的方式，成为了人类名义上的伙伴实际上的奴隶。
异兽族群破灭后，夺去了大量资源与生存空间的人类并