等大权于一身，在没有总督直辖的各省，巡抚便是一省之长，故而也有“封疆大吏”的俗称。雍正之后，因行“火耗归公”之制，巡抚每年也可以得到大笔“养廉银”的收入，以浙江巡抚为例，每年有一万两养廉银的进益。所以乾嘉之际，浙江巡抚也最是外省紧要之职。
浙江原有总督，但乾隆时已被裁撤，此时浙江巡抚便可独掌一省军政。当然，清代对督抚从来多有防范，浙江尚有杭州将军麾下的八旗兵，浙江绿营虽可以听巡抚调度，但提督、总兵任命仍然取决于朝廷，具体防卫作战事宜，也取决于各提镇，是以巡抚职权虽大，却也不至于谋反。嘉庆任命阮元去做浙江巡抚，在这一节上自然是放心的。
但阮元先前做学政时，便已对浙江弊政，多有了解，这时又听了那彦成所言，自然清楚浙江海防也已日渐紧要。如此内忧外患，自己一时之间，又怎能立刻便有解决之法？是以竟是许久都说不出一句话来，沉默了很长时间，才勉强应道：“这……回皇上，臣为官毕竟时日尚浅，所做的也不过是翰林、督学、礼仪之事，却从未任过治民之职，皇上如此任命臣去做巡抚，臣想着未免……未免有些草率。”
“朕觉得不草率啊。”嘉庆道：“阮侍郎，你十年为官，所任必有治绩，这一点朕看得很清楚啊。这说明，你也很重视朝廷名 器，无论给你什么职务，你都会尽力去办好。这浙江巡抚，朕想来也是一样。至于抚军治民，这读圣贤书，不就是为了学有所用吗？那些不读书的人，平日总是说读书无用，只能夸夸其谈，阮侍郎，你就不想认真做一番事业，好好回击一下他们吗？再说了，朝廷选士最关要处，便是科举，若是读书科举出来的进士，都做不了查吏治民的能臣，那这科举设来，又有何用呢？而且这一年来，朕看得清楚，和珅图谋不轨，几乎动用了一切他可以动用之人。可你呢，对京中禁军，前线各部，均是了如指掌，一一应对过去，竟将和珅之谋破了，这样看来，朕遣你去浙江整治绿营，还是大材小用了呢。”
“回皇上