竟会亲自率领绿营，前来征剿自己，只是自恃其勇，盲目与官军相抗。最初阮元劝谕他降服，他还心存侥幸，认为在车里作战，官军未必便有胜算。不想阮元眼看他拒不投降，竟然拿出数百门抬炮轰击头卡，不过一个时辰，头卡栅栏便被官军击破，而阮元带来的绿营主力，都是曾胜在云南时训练的部队，行进、放枪，俱皆习练有素。眼看官兵一举杀入头卡之中，土司寨的部众当即大乱，又一个时辰之后，便即弃了头卡。紧接着官军一鼓作气向前进兵，到了次日，刀绳武三座哨卡便全部被官兵击破，刀绳武眼看无力与官军相抗，也只得放弃了车里大寨，南逃边境去了。
“若是早知如此，我即便不走这一趟，或许也能打赢呢？”两日之后，阮元也亲自将刀太康迎回了车里寨中，眼看不过两日，传言中骄横跋扈的刀绳武便即溃败，阮元也不觉多了些感叹。
眼看车里之役已经基本结束，刀绳武所部尽皆溃散，再无重夺土司寨的可能，阮元便也留下胡启荣安顿降众，帮助刀太康暂时办理车里土司事务，自己则率领绿营主力北归昆明去了。由于战事持续时间不长，车里之地伤亡亦不算多，很快便即重归太平，而阮元也在九月之时顺利回到了昆明。
只是入滇途中的孔璐华，一时间却还不知阮元得胜归来的消息。到了八月末，孔璐华已经得知阮元南下车里，而她与阮孔厚一行也已经进入了贵州。谁知就在贵阳歇息之时，孔璐华却又染上疟疾，一时之间，再度高烧不止。阮孔厚和彭氏眼看孔璐华病弱之状，也只得连续在贵阳寻访名医为她诊治。这一日，一名医生应邀来到驿馆，为孔璐华诊脉之后，也不禁向各人叹道：
“夫人，这位公子，如今夫人的病，情况实在不算好啊？从病症上来看，夫人得的确实是疟疾没错，可夫人原本身体便即虚弱，如此一病，只怕元气大损，小人手中确实也有一些治疗疟疾的苗药，可是无一不需要病患本身身体强健，方能下药。若是直接为夫人用药，小人担心，夫人疟疾可以治好，却不能抵御其他疾病了，那样说来