城都地区位于关都地区的西边。
这两个地区其实位于同一块大陆上，和关都地区一样，这里气候温和。
在城都地区的东部，是一座连接着关都和城都两地的白银山。
而小智一行人的第一个目标，若叶镇，就是城都联盟挑战的起点。
他们要在这个若叶镇的神奇宝贝中心做登录，才能够报名参赛城都联盟白银大会。
可当他们到达这里的时候，却发现乔伊小姐并不在这里，而是去了空木博士的研究所。
“那就等等看吧！”小霞已经累坏了。
可小刚这位大姐姐控顿时就急了，“现在才不是沉着冷静的时候，都这么晚了还没回来，乔伊小姐一定是出了什么事了！”
没想到还真被小刚给说中了，小智两人被小刚拉着来到空木博士研究所的时候，正巧听到了警铃大作。
君莎小姐带人在研究所门口拉起了警戒线。
“君莎小姐，您辛苦了！”看到君莎小姐，小刚一下子就窜了过去，手里还不知什么时候出现了一捧鲜花。
您是哪学的魔术？
“我叫做小刚，请您多多指教！”
“我是为了要见你，才特地到这里来。。。。。”
话还没说完，他就被小霞给拉走了。
小智上前询问，“君莎小姐，请问这里就是空木博士研究所吗？”
小智和小霞身边都带着神奇宝贝，所以他们的身份很明显，君莎小姐当然不会为难他们。
原来，空木博士醉心研究，竟然让小锯鳄给人抱走了。
这小锯鳄可是城都地区交给新人训练家的水系御三家神奇宝贝。
这要是丢了，也就意味着会有一个新人训练家因为无法得到初始的神奇宝贝，而无法踏上旅程。
很快，君莎小姐组里的人员就发现了线索，推测应该是小偷留下的脚印。
一男一女一猫咪。
“果然是他们！”
小智和小霞对视