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光斗曾经在京畿屯田，李彦与他在此事上曾经有合作如今对阉党的清算已经进行过一段时间，罪大恶极的阉党领，已经给严审、严判，以杨涟、左光斗为的都察院，又开始向纵深挖掘，试图将阉党一网打尽。
事实上，都察院在审案中的权力比之从前有很大的增加，他们可以直接提审嫌犯，搜集证据，然后诉至大理寺。
不过御史们对于职权的变化还是有些不太习惯，虽然这边的权力增加，但是别的权力减少，让有些人对李彦的所作所为并不满意。
随着阉党清算的重头戏落下大幕，有的御史就开始弹劾李彦，李彦就此向孙承宗提出：若是本官有问题，可以让都察院来查、来审，但是上疏弹劾、风闻言事这种，无助于事情的解决，也不符合规定，希望都察院按照律法办事，作为司法机构，不能自己都不懂法律。
内阁先因为这件事生激烈的争吵，很多内阁成员都认为都察院御史风闻言事，此乃千古成法，李彦不能背弃祖宗做法，剥夺御史的这个权力。
李彦就拿出前定的一些律条，一条一条翻给他们看：“御史官员要做什么，朝廷官员应该怎么做事，之前已经定下基本规则，这一条明确说了，一定要按照规则办事，那么御史就不能违反规则，我们内阁也不能违反规则。”
“至于祖宗成法，那也很简，此一时彼一时，世易时移，以前的办法现在用了未必就能有同样的效果，具体到御史这个问题是按照老办法来做事，既然无法约束魏忠贤，又能起到什么作用？而在采用新办法以后，御史们审查起诉阉党份子，使其得到法律的制裁道不是说办法的优越之处吗？”
双方各执一，谁也说服不了谁，最后只能各自退让一步暂且保持现状，驳回都察院的做法，而在下次百官朝议之时，对此进行辩论、表决。
都察院事件表明保守势力已经始逐渐出现在李彦的对立面种理念上的分歧，也很难进行弥合，而保守势力在朝中的势力极为强大，在朝议之时，恐怕也难有胜