因为李雄事件，巴根台受到了木华黎万户和成吉思汗的斥责，但是并无严厉的惩罚。特种兵们感到巴根台诺颜变了，他越来越暴躁易怒，越来越多疑猜忌，目光也越来越凌厉狰狞。他动不动就鞭打部下，呵斥友军，对待敌人也越来越残暴，谁也不知道这是为什么。
巴根台拼命的克制自己，可是徒劳无益，他仍然不可遏止的大发雷霆。有时候他绝望的想，也许他已经得了战争焦虑综合症，他拼命的掩饰，努力表现的像个正常人，这让他更加暴躁。他感到他的特种兵们还是离他越来越远了，过去一个眼神他就知道部下们想什么，现在没有一个特种兵敢于正眼看他，也没有一个友军愿意和他协作交流，巴不得躲的他远远的。
成吉思汗是不可能看着东北的局势恶化的，他也不会抛弃忠实的朋友，他决定帮助耶律留哥。这一年秋，他派也特哥帅数千蒙古骑兵护送耶律留哥来到咸平府归仁县地区，召唤契丹旧部，重整部众。木华黎也派特种部队配合耶律留哥招降纳叛，巴根台大开杀戒，先后暗杀了耶厮不、喊舍、乞奴等契丹叛将。叛军阵营汲汲惶惶，无日不惊，那些蒙古特种兵简直防不胜防，怎么都难逃一死。
在蒙古人的大力支持下，耶律留哥的势力逐步恢复，而叛军势力则越来越衰弱，逐步向辽东退却。蒙古人和耶律留哥步步紧逼，重夺咸平府、韩州、信州、贵德州、隆州等地，将叛军一直逼到了高丽半岛。巴根台将耶律留哥的夫人姚里氏和长子薛阇等夺回，交到耶律留哥手中，留哥感激涕零，立即就派长子薛阇进入怯薛军，入侍大汗斡尔朵，表示完全的效忠。
安定了留哥，就等于扫清了木华黎南进的障碍。正当木华黎所部秣兵励马，准备南下东京辽阳的时候，被围已久的中都城终于陷落了，完颜承晖自尽，石抹燃尽忠突围。
此时成吉思汗正在恒州避暑，得到三木合拔都的捷报，立即派失吉忽图忽、汪古儿、阿儿孩合撒儿三人，到中都去清理府库财产。更重要的是，他要得到一个金国的大人才，就是后来的蒙