接下来的日子，袁方主要是抓城防建设，他几乎每天都泡在建设工地上，其目的一是督促和鼓舞，二是把好质量关。
不知不觉这样的日子就过去了大半年，袁方这里风平浪静，而朝堂上东林党和阉党之间的纷争更是刀光剑影的相互讨伐。
京察刚刚结束，朱由校就任命魏忠贤以司礼监秉笔太监领东厂事，给予魏忠贤很大的权利。
过完年没多久，魏忠贤就向东林党人举起了屠刀，他先是令许显纯把汪文言抓进了诏狱进行严刑拷打，想从他招出东林党人的罪行，汪文言是个硬骨头，宁死不屈，四月初，被许显纯打死在狱中。
这件事情传到袁方这里，他知道朝廷将会有一场血雨腥风，现在他只能是静观其变，虽然身在宁远，却时刻关注着京城的风云。
袁方有他的一套完善的情报系统，所以京城所发生的事情他都能够及时知道。
六月初，杨涟开始弹劾魏忠贤，并罗列了二十四条罪状，这个消息很快就传到了山海关。袁方刚刚得到这个消息，就接到了孙承宗的急招，让他连夜赶回山海关议事。
袁方知道，孙承宗招的这么急，一定是为魏忠贤的事情，果然，他一见到孙承宗，孙承宗就拿出了杨涟弹劾魏忠贤的二十四条罪状的副本给袁方看。
孙承宗极度地愤怒：“好你个魏忠贤，竟敢做出如此大逆不道之事，袁方你你就整顿人马随我进京收拾魏忠贤！”
袁方劝道：“恩师先不要冲动，请听学生一言。我们先弄清楚魏忠贤之罪，在起兵不迟。”
孙承宗道：“杨涟的折子上不是写得很清楚了吗？你也看看吧！”
袁方打开本子看了起来。
其年六月，涟
遂抗疏劾忠贤，列其二十四大罪，言：
高皇帝定令，内官不许干预外事，只供掖廷洒扫，违者法无赦。圣明在御，乃有肆无忌惮，浊乱朝常，如东厂太监魏忠贤者。敢列其罪状，为陛下言之。忠贤本市井无赖，中年净身，夤入内地，初犹