这时候的武昌城又成了众军无人指挥的状态，军政府只好临时授命蒋翊武以监军兼护理总司令。这时候的司令部，参谋长杨开甲辞职，副参谋长杨玺章在汉阳阵亡，蒋翊武只得命令吴兆麟为参谋长，姚金镛为副参谋长。
革命党人蔡济民、刘公、张振武、熊秉坤、邓玉麟、吴醒汉、公韧等紧紧地靠拢在蒋翊武周围，这使蒋翊武信心大增。11月28日晚上，蒋翊武在武昌都督府召开了军事会议，有关军事人员全部参加。会议上决定：设立总司令部于洪山宝通寺，划分防守区域、严明责任，派出小部队向武昌下游重镇黄州、鄂城居守，设兵站于各防御区域后方，海军在阳逻附近游弋，掩护武昌。
军事会议开完了后，各部队连夜按照命令，进入自己的防御阵地，构筑工事，执行任务。武昌城内本来极其混乱，但在刘公、蔡济民、张振武的指挥下，武昌城内开始有部队巡逻，处置乱民，安定民心，逮捕奸细，城内秩序渐渐趋于稳定。
11月29日上午8时，清军龟山炮队又向武昌城开炮射击，只打得武昌城内狼烟四起，火光闪闪，房屋一片片地倒塌。没有一会儿，民军的凤凰山炮台，蛇山、黄鹤楼炮队开始向龟山反击，只打得龟山顶上笼罩在一片浓浓的烟雾火光之中，不一会儿，龟山便成了缩头乌龟，再也没有了声响。
当时一些老百姓在观看炮战，无不欢欣鼓舞，热烈庆贺，大大地助长了民军的士气，灭了清狗子的威风。
蒋翊武派公韧和唐青盈重新组织敢死队，时刻注意“保护”都督府，以防备意外情况发生。28日晚上，公韧和唐青盈在都督府外巡查时，突然听到都督府内人声嘈杂，还有一些车马的声音。两个人感到情况异常，忙到都督府内观看，原来是黎元洪和他的一些亲信正在收拾行李，装着马车，有要逃离都督府的迹象。
公韧上前问黎元洪：“黎都督，这是上哪里去啊？”黎元洪对公韧摆了摆手说：“我的事情你不要管。”公韧说：“黎都督是不是要逃跑啊？”黎元洪不再理会公韧